Aphidicolin

Peta Jejaring Molekuler

Obat Target Gen Interaksi Enzim Transporter Carrier

Legenda: Obat • Target • Gen • Enzim • (Panah → menunjukkan arah efek / relasi) • Transporter • Carrier

1. Pendahuluan & Konsep

Fitur visualisasi ini dikembangkan menggunakan pendekatan Graph Theory untuk memetakan hubungan polifarmasi dan molekuler. Entitas (Obat, Target, Gen) direpresentasikan sebagai Simpul (Nodes), sedangkan hubungan biologisnya sebagai Sisi (Edges).

2. Sumber Data (Validasi)

Data Obat: Diekstraksi dari elemen drugbank-id dan name pada skema XML DrugBank.
Target Protein: Diambil dari elemen targets/target yang memuat polipeptida sasaran.
Genetik: Disinkronisasi dari sub-elemen gene-name dan varian snp-effects.
Genetik: Jumlah titik node dibatasi pada maksimal 10 (Slice=10) interaksi untuk menghindari tumpukan data.

3. Algoritma Visualisasi

Tata letak grafik menggunakan algoritma Force-Directed Graph (Barnes-Hut). Model fisika ini menerapkan gaya tolak-menolak antar simpul (Gravitasi: -3000) agar tidak tumpang tindih, serta gaya pegas (Spring: 0.04) pada garis penghubung untuk fleksibilitas interaksi.

4. Legenda Visual

Obat Utama (Pusat Analisis)

Target Protein (Mekanisme)

Gen (Faktor Genetik)

Metode ini mendukung analisis Precision Medicine dan evaluasi risiko Drug-Drug Interaction (DDI).

Profil Farmakokinetik

Waktu Paruh (Half-Life) -

Volume Distribusi -

Klirens (Clearance) -

Absorpsi

Data absorpsi tidak tersedia.

Metabolisme

Data metabolisme tidak tersedia.

Rute Eliminasi

Data eliminasi belum tersedia.

Interaksi Obat

0 Data

Tidak ada data.

Target Protein

DNA polymerase catalytic subunit

Referensi & Sumber

Artikel (PubMed)

PMID: 6793260
Waters R: Aphidicolin: an inhibitor of DNA repair in human fibroblasts. Carcinogenesis. 1981;2(8):795-7. doi: 10.1093/carcin/2.8.795.
PMID: 25429975
Baranovskiy AG, Babayeva ND, Suwa Y, Gu J, Pavlov YI, Tahirov TH: Structural basis for inhibition of DNA replication by aphidicolin. Nucleic Acids Res. 2014 Dec 16;42(22):14013-21. doi: 10.1093/nar/gku1209. Epub 2014 Nov 27.

Contoh Produk & Brand

Produk: 0 • International brands: 0

Belum ada data produk/brand untuk obat ini pada database. Jalankan import DrugBank untuk mengisi field produk/brand.

Sekuens Gen/Protein (FASTA)

Sekuens dimuat saat dibutuhkan agar halaman tetap ringan.

Deskripsi

Struktur Molekul 2D

Deskripsi metode visualisasi