Thymoquinone

Peta Jejaring Molekuler

Obat Target Gen Interaksi Enzim Transporter Carrier

Legenda: Obat • Target • Gen • Enzim • (Panah → menunjukkan arah efek / relasi) • Transporter • Carrier

1. Pendahuluan & Konsep

Fitur visualisasi ini dikembangkan menggunakan pendekatan Graph Theory untuk memetakan hubungan polifarmasi dan molekuler. Entitas (Obat, Target, Gen) direpresentasikan sebagai Simpul (Nodes), sedangkan hubungan biologisnya sebagai Sisi (Edges).

2. Sumber Data (Validasi)

Data Obat: Diekstraksi dari elemen drugbank-id dan name pada skema XML DrugBank.
Target Protein: Diambil dari elemen targets/target yang memuat polipeptida sasaran.
Genetik: Disinkronisasi dari sub-elemen gene-name dan varian snp-effects.
Genetik: Jumlah titik node dibatasi pada maksimal 10 (Slice=10) interaksi untuk menghindari tumpukan data.

3. Algoritma Visualisasi

Tata letak grafik menggunakan algoritma Force-Directed Graph (Barnes-Hut). Model fisika ini menerapkan gaya tolak-menolak antar simpul (Gravitasi: -3000) agar tidak tumpang tindih, serta gaya pegas (Spring: 0.04) pada garis penghubung untuk fleksibilitas interaksi.

4. Legenda Visual

Obat Utama (Pusat Analisis)

Target Protein (Mekanisme)

Gen (Faktor Genetik)

Metode ini mendukung analisis Precision Medicine dan evaluasi risiko Drug-Drug Interaction (DDI).

Profil Farmakokinetik

Waktu Paruh (Half-Life) -

Volume Distribusi -

Klirens (Clearance) -

Absorpsi

Data absorpsi tidak tersedia.

Metabolisme

Data metabolisme tidak tersedia.

Rute Eliminasi

Data eliminasi belum tersedia.

Interaksi Obat

0 Data

Tidak ada data.

Target Protein

Cellular tumor antigen p53 TP53

Apoptosis regulator Bcl-2 BCL2

Apoptosis regulator BAX BAX

Referensi & Sumber

Artikel (PubMed)

PMID: 29437018
Shaterzadeh-Yazdi H, Noorbakhsh MF, Hayati F, Samarghandian S, Farkhondeh T: Immunomodulatory and Anti-inflammatory Effects of Thymoquinone. Cardiovasc Hematol Disord Drug Targets. 2018;18(1):52-60. doi: 10.2174/1871529X18666180212114816.
PMID: 29966985
Imran M, Rauf A, Khan IA, Shahbaz M, Qaisrani TB, Fatmawati S, Abu-Izneid T, Imran A, Rahman KU, Gondal TA: Thymoquinone: A novel strategy to combat cancer: A review. Biomed Pharmacother. 2018 Oct;106:390-402. doi: 10.1016/j.biopha.2018.06.159. Epub 2018 Jul 11.
PMID: 25829334
Darakhshan S, Bidmeshki Pour A, Hosseinzadeh Colagar A, Sisakhtnezhad S: Thymoquinone and its therapeutic potentials. Pharmacol Res. 2015 May-Jun;95-96:138-58. doi: 10.1016/j.phrs.2015.03.011. Epub 2015 Mar 28.
PMID: 28551846
Velagapudi R, El-Bakoush A, Lepiarz I, Ogunrinade F, Olajide OA: AMPK and SIRT1 activation contribute to inhibition of neuroinflammation by thymoquinone in BV2 microglia. Mol Cell Biochem. 2017 Nov;435(1-2):149-162. doi: 10.1007/s11010-017-3064-3. Epub 2017 May 27.
PMID: 27364039
Gholamnezhad Z, Havakhah S, Boskabady MH: Preclinical and clinical effects of Nigella sativa and its constituent, thymoquinone: A review. J Ethnopharmacol. 2016 Aug 22;190:372-86. doi: 10.1016/j.jep.2016.06.061. Epub 2016 Jun 27.

Contoh Produk & Brand

Produk: 0 • International brands: 0

Belum ada data produk/brand untuk obat ini pada database. Jalankan import DrugBank untuk mengisi field produk/brand.

Sekuens Gen/Protein (FASTA)

Sekuens dimuat saat dibutuhkan agar halaman tetap ringan.

Deskripsi

Struktur Molekul 2D

Deskripsi metode visualisasi