Trypan blue free acid

Peta Jejaring Molekuler

Obat Target Gen Interaksi Enzim Transporter Carrier

Legenda: Obat • Target • Gen • Enzim • (Panah → menunjukkan arah efek / relasi) • Transporter • Carrier

1. Pendahuluan & Konsep

Fitur visualisasi ini dikembangkan menggunakan pendekatan Graph Theory untuk memetakan hubungan polifarmasi dan molekuler. Entitas (Obat, Target, Gen) direpresentasikan sebagai Simpul (Nodes), sedangkan hubungan biologisnya sebagai Sisi (Edges).

2. Sumber Data (Validasi)

Data Obat: Diekstraksi dari elemen drugbank-id dan name pada skema XML DrugBank.
Target Protein: Diambil dari elemen targets/target yang memuat polipeptida sasaran.
Genetik: Disinkronisasi dari sub-elemen gene-name dan varian snp-effects.
Genetik: Jumlah titik node dibatasi pada maksimal 10 (Slice=10) interaksi untuk menghindari tumpukan data.

3. Algoritma Visualisasi

Tata letak grafik menggunakan algoritma Force-Directed Graph (Barnes-Hut). Model fisika ini menerapkan gaya tolak-menolak antar simpul (Gravitasi: -3000) agar tidak tumpang tindih, serta gaya pegas (Spring: 0.04) pada garis penghubung untuk fleksibilitas interaksi.

4. Legenda Visual

Obat Utama (Pusat Analisis)

Target Protein (Mekanisme)

Gen (Faktor Genetik)

Metode ini mendukung analisis Precision Medicine dan evaluasi risiko Drug-Drug Interaction (DDI).

Profil Farmakokinetik

Waktu Paruh (Half-Life) -

Volume Distribusi -

Klirens (Clearance) -

Absorpsi

Data absorpsi tidak tersedia.

Metabolisme

Data metabolisme tidak tersedia.

Rute Eliminasi

Data eliminasi belum tersedia.

Interaksi Obat

0 Data

Tidak ada data.

Target Protein

Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1 PTPN1

Referensi & Sumber

Artikel (PubMed)

PMID: 18432654
Strober W: Trypan blue exclusion test of cell viability. Curr Protoc Immunol. 2001 May;Appendix 3:Appendix 3B. doi: 10.1002/0471142735.ima03bs21.

Link

FDA label

Contoh Produk & Brand

Produk: 3 • International brands: 0

Produk

Membraneblue

Injection, solution • 0.75 mg/0.5mL • Intraocular; Ophthalmic • US • Approved
Visionblue

Injection, solution • 0.3 mg/0.5mL • Intraocular; Ophthalmic • US • Approved
Visionblue

Solution • 0.06 % • Intraocular • Canada • Approved

Sekuens Gen/Protein (FASTA)

Sekuens dimuat saat dibutuhkan agar halaman tetap ringan.

Peringatan Keamanan

Deskripsi

Struktur Molekul 2D

Deskripsi metode visualisasi