CTCE-0214

Peta Jejaring Molekuler

Obat Target Gen Interaksi Enzim Transporter Carrier

Legenda: Obat • Target • Gen • Enzim • (Panah → menunjukkan arah efek / relasi) • Transporter • Carrier

1. Pendahuluan & Konsep

Fitur visualisasi ini dikembangkan menggunakan pendekatan Graph Theory untuk memetakan hubungan polifarmasi dan molekuler. Entitas (Obat, Target, Gen) direpresentasikan sebagai Simpul (Nodes), sedangkan hubungan biologisnya sebagai Sisi (Edges).

2. Sumber Data (Validasi)

Data Obat: Diekstraksi dari elemen drugbank-id dan name pada skema XML DrugBank.
Target Protein: Diambil dari elemen targets/target yang memuat polipeptida sasaran.
Genetik: Disinkronisasi dari sub-elemen gene-name dan varian snp-effects.
Genetik: Jumlah titik node dibatasi pada maksimal 10 (Slice=10) interaksi untuk menghindari tumpukan data.

3. Algoritma Visualisasi

Tata letak grafik menggunakan algoritma Force-Directed Graph (Barnes-Hut). Model fisika ini menerapkan gaya tolak-menolak antar simpul (Gravitasi: -3000) agar tidak tumpang tindih, serta gaya pegas (Spring: 0.04) pada garis penghubung untuk fleksibilitas interaksi.

4. Legenda Visual

Obat Utama (Pusat Analisis)

Target Protein (Mekanisme)

Gen (Faktor Genetik)

Metode ini mendukung analisis Precision Medicine dan evaluasi risiko Drug-Drug Interaction (DDI).

Profil Farmakokinetik

Waktu Paruh (Half-Life) -

Volume Distribusi -

Klirens (Clearance) -

Absorpsi

Data absorpsi tidak tersedia.

Metabolisme

Data metabolisme tidak tersedia.

Rute Eliminasi

Data eliminasi belum tersedia.

Interaksi Obat

0 Data

Tidak ada data.

Target Protein

Stromal cell-derived factor 1 CXCL12

Referensi & Sumber

Artikel (PubMed)

PMID: 17541466
Faber A, Roderburg C, Wein F, Saffrich R, Seckinger A, Horsch K, Diehlmann A, Wong D, Bridger G, Eckstein V, Ho AD, Wagner W: The many facets of SDF-1alpha, CXCR4 agonists and antagonists on hematopoietic progenitor cells. J Biomed Biotechnol. 2007;2007(3):26065. Epub 2007 Apr 23.
PMID: 16123381
Li K, Chuen CK, Lee SM, Law P, Fok TF, Ng PC, Li CK, Wong D, Merzouk A, Salari H, Gu GJ, Yuen PM: Small peptide analogue of SDF-1alpha supports survival of cord blood CD34+ cells in synergy with other cytokines and enhances their ex vivo expansion and engraftment into nonobese diabetic/severe combined immunodeficient mice. Stem Cells. 2006 Jan;24(1):55-64. Epub 2005 Aug 25.
PMID: 15003316
Perez LE, Alpdogan O, Shieh JH, Wong D, Merzouk A, Salari H, O'Reilly RJ, van den Brink MR, Moore MA: Increased plasma levels of stromal-derived factor-1 (SDF-1/CXCL12) enhance human thrombopoiesis and mobilize human colony-forming cells (CFC) in NOD/SCID mice. Exp Hematol. 2004 Mar;32(3):300-7.

Contoh Produk & Brand

Produk: 0 • International brands: 0

Belum ada data produk/brand untuk obat ini pada database. Jalankan import DrugBank untuk mengisi field produk/brand.

Sekuens Gen/Protein (FASTA)

Sekuens dimuat saat dibutuhkan agar halaman tetap ringan.

Deskripsi

Struktur Molekul 2D

Deskripsi metode visualisasi