Tagetitoxin

Peta Jejaring Molekuler

Obat Target Gen Interaksi Enzim Transporter Carrier

Legenda: Obat • Target • Gen • Enzim • (Panah → menunjukkan arah efek / relasi) • Transporter • Carrier

1. Pendahuluan & Konsep

Fitur visualisasi ini dikembangkan menggunakan pendekatan Graph Theory untuk memetakan hubungan polifarmasi dan molekuler. Entitas (Obat, Target, Gen) direpresentasikan sebagai Simpul (Nodes), sedangkan hubungan biologisnya sebagai Sisi (Edges).

2. Sumber Data (Validasi)

Data Obat: Diekstraksi dari elemen drugbank-id dan name pada skema XML DrugBank.
Target Protein: Diambil dari elemen targets/target yang memuat polipeptida sasaran.
Genetik: Disinkronisasi dari sub-elemen gene-name dan varian snp-effects.
Genetik: Jumlah titik node dibatasi pada maksimal 10 (Slice=10) interaksi untuk menghindari tumpukan data.

3. Algoritma Visualisasi

Tata letak grafik menggunakan algoritma Force-Directed Graph (Barnes-Hut). Model fisika ini menerapkan gaya tolak-menolak antar simpul (Gravitasi: -3000) agar tidak tumpang tindih, serta gaya pegas (Spring: 0.04) pada garis penghubung untuk fleksibilitas interaksi.

4. Legenda Visual

Obat Utama (Pusat Analisis)

Target Protein (Mekanisme)

Gen (Faktor Genetik)

Metode ini mendukung analisis Precision Medicine dan evaluasi risiko Drug-Drug Interaction (DDI).

Profil Farmakokinetik

Waktu Paruh (Half-Life) -

Volume Distribusi -

Klirens (Clearance) -

Absorpsi

Data absorpsi tidak tersedia.

Metabolisme

Data metabolisme tidak tersedia.

Rute Eliminasi

Data eliminasi belum tersedia.

Interaksi Obat

0 Data

Tidak ada data.

Target Protein

DNA-directed RNA polymerase subunit beta rpoB

DNA-directed RNA polymerase subunit beta' rpoC

Referensi & Sumber

Artikel (PubMed)

PMID: 16518489
Plet JR, Porter MJ: Synthesis of the bicyclic core of tagetitoxin. Chem Commun (Camb). 2006 Mar 21;(11):1197-9. Epub 2006 Feb 14.
PMID: 16273103
Vassylyev DG, Svetlov V, Vassylyeva MN, Perederina A, Igarashi N, Matsugaki N, Wakatsuki S, Artsimovitch I: Structural basis for transcription inhibition by tagetitoxin. Nat Struct Mol Biol. 2005 Dec;12(12):1086-93. Epub 2005 Nov 6.
PMID: 7918417
Mathews DE, Durbin RD: Mechanistic aspects of tagetitoxin inhibition of RNA polymerase from Escherichia coli. Biochemistry. 1994 Oct 4;33(39):11987-92.
PMID: 2403565
Steinberg TH, Mathews DE, Durbin RD, Burgess RR: Tagetitoxin: a new inhibitor of eukaryotic transcription by RNA polymerase III. J Biol Chem. 1990 Jan 5;265(1):499-505.

Contoh Produk & Brand

Produk: 0 • International brands: 0

Belum ada data produk/brand untuk obat ini pada database. Jalankan import DrugBank untuk mengisi field produk/brand.

Sekuens Gen/Protein (FASTA)

Sekuens dimuat saat dibutuhkan agar halaman tetap ringan.

Deskripsi

Struktur Molekul 2D

Deskripsi metode visualisasi